スタッフは最低何人いれば上演できますか？

最低ラインは役者の3人になります。
・音響をナインとアスクが分担する
・照明もナインとアスクが分担する
・照明は全照か暗転のみ
といった感じで、他に本番当日だけ会場入り口を閉じるお手伝いさんがいればOKかと。

アスクとアスクのシーンではセットをどうやって切り替えていましたか？

上手側に一人で動かせる大きさの「ドア」を作って、そのドアを引っ張り出したり舞台袖に隠してたりして終わりです。
あれがスタッフが少ない状況で出来る一番いいアイディアだったと思います。
Mr.myfriendNo.nineの上演データページに大ざっぱな見取り図があるので、参考にならないかも知れませんが参考にしてみて下さい。
ちなみにオリジナル公演のスタッフ達は密かに「アスクがすんでる部屋は、実はナインとパストが暮らした部屋だったのだ！！」って裏設定を作ってたみたいです。
「だからマグカップも一緒なんだぜっ！」って、小道具を使い分けない事の言い訳にしたりして結構面白かったですね。
まあ・・・それだと色々破綻しそうですが、なにごともアイディアということで。

ステージが広すぎるんですが、舞台セットの表現でうまい方法はありますか？

以前演劇コンクールで上演していただいた方の例だと「アスクの部屋、ナインの部屋を同じステージの左右に分けて設置し、パストがその間を行ったり来たりする」という表現をしていました。
移動とか演出方法をアスク→ナインのシーンで表すと
まずアスクとの会話中はアスクの部屋だけにスポット照明が当たっています。ナインは暗いところ全く動かずにいます。
そで、台詞が終わると舞台が暗転し、パストがナインの部屋に移動。
準備完了でナインの部屋に向けてスポットが当たり、アスクは暗闇で固まっている。
こんな感じです。
公演のビデオを見たんですが、舞台の広さにちょうどフィットしていましたし、動きもかなり自然に出来てで無理矢理感は無かったですね。

クラス会での上演で30分しか持ち時間がありません。
脚本を書き換えてもいいですか？

はい。
この場合、かなり難しいでしょうが変更していただいて構いません。
カットする量が多そうなので、完成台本を確認させて頂くことになります。
もちろん、それで見て使用許可を取り消したりはしないのでご安心を。